EU:n on ajettava ihmisoikeuksia kansainvälisesti, mutta se ei saa kansainvälisessä työssään sivuttaa jäsenmaissa esiintyviä ongelmia. Maahanmuuttajiin ja erilaisiin vähemmistöihin kohdistuvat ihmisoikeusrikkomukset Euroopan unionin jäsenmaissa ovat valitettavan yleisiä. Ihmisoikeusrikkomukset ja rasismi Keski-Euroopassa ovat ajaneet esimerkiksi romaneita turvapaikanhakijoiksi toisiin jäsenmaihin. Seksuaali- ja sukupuolivähemmistöihin kohdistuvat ennakkoluulot ja väkivallanteot ovat edelleen osa Euroopan unionin jäsenmaiden arkea. Useissa jäsenmaissa Gay pride – kulkueet on kielletty tai ne ovat päättyneet väkivaltaisiin hyökkäyksiin. Euroopan unionin alueella on ihmisillä oltava oikeus toimia yhteiskunnassa kohtaamatta syrjintää tai rajoituksia ilmaisun- tai kokoontumisvapaudessa.